经济全球化和跨国创新网络的形成和发展，对日本传统的创新模式带来了巨大挑战。与国家创新政策相比，区域创新政策更加灵活，更适合依据区域的不同特点进行调整，因而更适于应对全球技术创新领域的竞争。日本正由更多依赖国家创新，向依靠区域创新和构建创新体系转变。日本通过完善包括知识集聚示范区在内的区域创新模式、政策工具，以及合理分配在多重治理结构下区域创新管理机构的管理权限和责任，实现了不同创新主体之间的互动与合作，缩小了与全球技术创新水平及区域技术创新水平的差距，促进了日本创新能力的提升。